MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 75679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013851	CCGA	2	8	24311	24318	25 %	0 %	25 %	50 %	288939788
502	NC_013851	CAT	2	6	24333	24338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939788
503	NC_013851	TCGAAC	2	12	24373	24384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288939788
504	NC_013851	CG	3	6	24391	24396	0 %	0 %	50 %	50 %	288939788
505	NC_013851	CCGG	3	12	24397	24408	0 %	0 %	50 %	50 %	288939788
506	NC_013851	GGA	2	6	24497	24502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939788
507	NC_013851	CGA	2	6	24503	24508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939788
508	NC_013851	CTG	2	6	24518	24523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939789
509	NC_013851	AGA	2	6	24529	24534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939789
510	NC_013851	CGA	2	6	24535	24540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939789
511	NC_013851	GC	5	10	24595	24604	0 %	0 %	50 %	50 %	288939789
512	NC_013851	GCC	3	9	24647	24655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939789
513	NC_013851	GC	3	6	24709	24714	0 %	0 %	50 %	50 %	288939789
514	NC_013851	GC	4	8	24747	24754	0 %	0 %	50 %	50 %	288939789
515	NC_013851	CGA	2	6	24796	24801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939789
516	NC_013851	CG	4	8	24838	24845	0 %	0 %	50 %	50 %	288939789
517	NC_013851	CCG	2	6	24859	24864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939789
518	NC_013851	CGC	2	6	24865	24870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939789
519	NC_013851	CATC	2	8	24952	24959	25 %	25 %	0 %	50 %	288939789
520	NC_013851	TC	3	6	24958	24963	0 %	50 %	0 %	50 %	288939789
521	NC_013851	GCA	2	6	24997	25002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939789
522	NC_013851	CGT	2	6	25012	25017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939789
523	NC_013851	AGC	2	6	25038	25043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939789
524	NC_013851	GGTC	2	8	25090	25097	0 %	25 %	50 %	25 %	288939789
525	NC_013851	GCG	2	6	25102	25107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939789
526	NC_013851	GAC	2	6	25166	25171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939789
527	NC_013851	GC	3	6	25252	25257	0 %	0 %	50 %	50 %	288939790
528	NC_013851	CTG	2	6	25278	25283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939790
529	NC_013851	CGC	3	9	25370	25378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939790
530	NC_013851	GCGTTC	2	12	25499	25510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939790
531	NC_013851	GAC	2	6	25542	25547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939790
532	NC_013851	CCGG	2	8	25587	25594	0 %	0 %	50 %	50 %	288939790
533	NC_013851	GCG	2	6	25616	25621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939790
534	NC_013851	CGG	2	6	25633	25638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939790
535	NC_013851	TCG	2	6	25693	25698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939790
536	NC_013851	CCG	2	6	25714	25719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939790
537	NC_013851	GATCCA	2	12	25772	25783	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288939790
538	NC_013851	GTCG	2	8	25836	25843	0 %	25 %	50 %	25 %	288939790
539	NC_013851	CCG	2	6	25954	25959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939790
540	NC_013851	CGAC	2	8	25999	26006	25 %	0 %	25 %	50 %	288939790
541	NC_013851	GCCGG	2	10	26020	26029	0 %	0 %	60 %	40 %	288939790
542	NC_013851	CGTCG	2	10	26079	26088	0 %	20 %	40 %	40 %	288939790
543	NC_013851	CG	5	10	26103	26112	0 %	0 %	50 %	50 %	288939790
544	NC_013851	CCG	2	6	26127	26132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939790
545	NC_013851	CG	4	8	26138	26145	0 %	0 %	50 %	50 %	288939790
546	NC_013851	GTC	2	6	26151	26156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939790
547	NC_013851	CGCC	2	8	26194	26201	0 %	0 %	25 %	75 %	288939790
548	NC_013851	CTG	2	6	26289	26294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939790
549	NC_013851	GC	3	6	26313	26318	0 %	0 %	50 %	50 %	288939790
550	NC_013851	CGA	2	6	26384	26389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939790
551	NC_013851	CGA	2	6	26447	26452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939790
552	NC_013851	GGC	2	6	26511	26516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939790
553	NC_013851	CTG	2	6	26550	26555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939790
554	NC_013851	GAGC	2	8	26593	26600	25 %	0 %	50 %	25 %	288939790
555	NC_013851	GC	3	6	26725	26730	0 %	0 %	50 %	50 %	288939791
556	NC_013851	CAT	2	6	26731	26736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939791
557	NC_013851	TGT	2	6	26751	26756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939791
558	NC_013851	GGAC	2	8	26812	26819	25 %	0 %	50 %	25 %	288939791
559	NC_013851	TCGC	2	8	26840	26847	0 %	25 %	25 %	50 %	288939791
560	NC_013851	GCT	3	9	26866	26874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939791
561	NC_013851	GCT	2	6	26950	26955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939791
562	NC_013851	CTGA	2	8	27002	27009	25 %	25 %	25 %	25 %	288939791
563	NC_013851	CAC	3	9	27037	27045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939791
564	NC_013851	GCC	2	6	27079	27084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939791
565	NC_013851	CAG	2	6	27104	27109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939791
566	NC_013851	CGG	2	6	27121	27126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939791
567	NC_013851	TGGGCG	2	12	27168	27179	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	288939791
568	NC_013851	CGC	2	6	27234	27239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939791
569	NC_013851	GC	3	6	27254	27259	0 %	0 %	50 %	50 %	288939791
570	NC_013851	GCC	2	6	27290	27295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939791
571	NC_013851	CTGG	2	8	27310	27317	0 %	25 %	50 %	25 %	288939791
572	NC_013851	CGG	2	6	27370	27375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939791
573	NC_013851	CCAT	2	8	27471	27478	25 %	25 %	0 %	50 %	288939791
574	NC_013851	TCG	2	6	27480	27485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939791
575	NC_013851	GGC	2	6	27557	27562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939791
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577	NC_013851	TCG	2	6	27617	27622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939791
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579	NC_013851	CAT	2	6	27652	27657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939791
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581	NC_013851	GGC	2	6	27749	27754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939791
582	NC_013851	CGG	2	6	27759	27764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939791
583	NC_013851	TGC	2	6	27777	27782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939791
584	NC_013851	TGC	2	6	27789	27794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939791
585	NC_013851	GTT	2	6	27817	27822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939791
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587	NC_013851	TCA	2	6	27873	27878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939791
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592	NC_013851	GCC	2	6	27959	27964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939791
593	NC_013851	CAC	2	6	28000	28005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939791
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595	NC_013851	GGCGG	2	10	28099	28108	0 %	0 %	80 %	20 %	288939791
596	NC_013851	GCT	2	6	28123	28128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939791
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598	NC_013851	GCA	2	6	28200	28205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939792
599	NC_013851	CCG	2	6	28238	28243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939792
600	NC_013851	CG	3	6	28242	28247	0 %	0 %	50 %	50 %	288939792
601	NC_013851	GCC	2	6	28273	28278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939792
602	NC_013851	GGTCAG	2	12	28393	28404	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288939792
603	NC_013851	GC	4	8	28424	28431	0 %	0 %	50 %	50 %	288939792
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605	NC_013851	CGG	2	6	28449	28454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939792
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607	NC_013851	GGT	2	6	28516	28521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939792
608	NC_013851	TGC	2	6	28539	28544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939792
609	NC_013851	CGG	2	6	28678	28683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939792
610	NC_013851	GC	3	6	28693	28698	0 %	0 %	50 %	50 %	288939792
611	NC_013851	CATC	2	8	28971	28978	25 %	25 %	0 %	50 %	288939793
612	NC_013851	GAC	2	6	29006	29011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939793
613	NC_013851	GC	3	6	29031	29036	0 %	0 %	50 %	50 %	288939793
614	NC_013851	GCC	2	6	29041	29046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939793
615	NC_013851	CGGAC	2	10	29061	29070	20 %	0 %	40 %	40 %	288939793
616	NC_013851	GTTCG	2	10	29078	29087	0 %	40 %	40 %	20 %	288939793
617	NC_013851	TC	3	6	29135	29140	0 %	50 %	0 %	50 %	288939794
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619	NC_013851	GCC	3	9	29208	29216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939794
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621	NC_013851	GGC	3	9	29276	29284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939794
622	NC_013851	CCGG	2	8	29321	29328	0 %	0 %	50 %	50 %	288939794
623	NC_013851	CGC	2	6	29360	29365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939794
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625	NC_013851	GCC	2	6	29442	29447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939794
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627	NC_013851	CTGG	2	8	29504	29511	0 %	25 %	50 %	25 %	288939794
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